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《Nature》:小胶质细胞修复功能的维持可促进脑卒中恢复。

作者:   发布于:2026年05月27日  点击量:35

2026年5月13日,由日本东京科学大学Takashi Shichita教授研究团队,在国际顶尖期刊Nature在线发表题为:Sustaining microglial reparative function enhances stroke recovery的论文。研究发现,中风后急性期修复型小胶质细胞并未消失,而是28天后转为失能型小胶质细胞;利用反义寡核苷酸靶向转录因子ZFP384可重启其修复功能,促进中风长期恢复。

该研究利用胰岛素样生长因子1-增强型绿色荧光蛋白(Igf1-eGFP)报告基因小鼠首次证明修复型小胶质细胞失能而非消失,解释恢复停滞机制;确认转录因子ZFP384 是慢性期神经修复的全新靶点;打破中风病程恢复 “黄金期” 限制,慢性期(数月后)仍可干预,使得治疗窗口延长;反义寡核苷酸(ASO) 技术成熟,安全性高,有望成为中风长期康复的首个免疫修复疗法,临床价值可期。

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论文官网截图

脑损伤(尤以脑卒中,也就是俗称的中风)是造成重度残疾的主要原因,也是全球范围内缩短人群健康预期寿命的重要因素。脑卒中会诱发急性炎症反应与脑水肿,进一步恶化患者预后,因此目前相关研究多聚焦于急性期治疗与疾病预防。

患者度过急性期后,脑部炎症通常在发病约一周后逐步消退,机体自身的脑修复机制开始发挥作用,改善神经功能缺损。康复训练是目前促进损伤修复、改善功能预后的常用手段,但尚无专门用于增强修复进程的治疗药物。

无论是脑卒中患者还是模型动物,脑部的自发性修复作用一般会在损伤后数月内逐渐消失,而导致脑细胞修复功能衰退的细胞及分子机制仍未阐明。若脑部修复不完全,残留的神经功能缺损会演变为永久性后遗症,对患者造成终身影响。因此,亟需挖掘可延长脑细胞修复能力的治疗靶点,以实现脑部功能的持续性恢复。

小胶质细胞在脑损伤后的修复进程中发挥关键作用。现有研究证实,脑髓系细胞具有高度异质性,这类细胞不仅是维持大脑稳态的核心组分,还能快速响应脑部各类应激刺激。脑卒中这类重度脑损伤会激活髓系细胞,诱发炎症并加剧脑组织损伤;而进入修复阶段、炎症消退后,髓系细胞的功能会发生转变,转而发挥修复作用。

胰岛素样生长因子1(IGF1)是修复型髓系细胞分泌的典型神经营养因子,可促进轴突生长与突触形成。缺血性脑卒中发病数日后,若清除体内髓系细胞,会导致 IGF1 分泌减少,神经元损伤进一步加重。表达IGF1的小胶质细胞还可分泌骨桥蛋白(SPP1)、神经因子(NENF)、生长分化因子、成纤维细胞生长因子等多种修复因子,上述因子均对神经元修复至关重要。因此,小胶质细胞、巨噬细胞及中性粒细胞在脑损伤后神经元修复中的作用,已成为脑部疾病极具潜力的治疗研究方向。

迄今为止,修复型脑细胞的细胞命运尚不明确。髓系细胞修复功能衰退后,可能通过凋亡或迁出受损脑组织而消失;也可能留存于损伤区域,转化为功能耗竭型或记忆样髓系细胞,其基因表达谱与稳态髓系细胞趋于一致。如今,全基因组表达分析、寡核苷酸疗法等前沿实验与临床技术,为探究及调控小胶质细胞功能提供了条件。在各类脑细胞中,小胶质细胞对治疗性反义寡核苷酸(ASO)具备极强的内化能力。

本研究发现,脑卒中后,修复型髓系细胞并未消失,而是转变为功能耗竭细胞滞留于脑组织内,彻底丧失修复能力。ZFP384表达上调会抑制修复相关基因的表达;髓系细胞特异性敲除Zfp384,或是向脑室内注射靶向Zfp384的反义寡核苷酸,均可长期维持髓系细胞的多重神经修复功能,有效促进脑卒中后的功能恢复。

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机制通路:缺血性中风 → 急性期促炎 → 亚急性期(7天)修复型小胶质细胞(YY1 激活修复基因) → 慢性期(28 天)TGF-β↑ → ZFP384↑ → 抑制 YY1 → 修复基因关闭 → 小胶质细胞失能 → 恢复停滞


ZFP384(亦称作CIZ 或 NMP4,人源叫 ZNF384)是一种在多种生物学过程中起关键作用的转录调控因子。它属于C2H2型锌指蛋白家族,能够结合特定DNA序列从而调控下游基因的表达。ZFP384在骨代谢、炎症、肿瘤发生等多个生理病理过程中发挥重要作用。YY1:全称:Yin Yang 1(阴阳因子 1),正式全称写作:YY1 transcription factor(YY1 转录因子)。YY1 是一种广泛存在的多能转录因子,其功能发挥高度依赖核基质。其为GLI‑Kruppel 类锌指蛋白,兼具转录激活与抑制双重功能,故得名 “阴阳”。ZFP384 虽然在序列上与 YY1 差异较大,但在功能上与核基质存在直接的对抗与调控关系。ZFP384 的表达会破坏 YY1 在核基质上搭建的修复性转录结构,导致原本应该促进大脑修复的基因无法表达。简而言之,ZFP384 是导致 YY1 在核基质上的“组织工作”失效的抑制剂。

为明确修复型髓系细胞的命运,本研究首先利用Igf1-eGFP 转基因小鼠分析缺血性脑卒中修复阶段的基因表达特征。该品系小鼠将增强型绿色荧光蛋白(eGFP)报告基因置于Igf1基因的启动子 / 增强子区域下游,而Igf1是修复型髓系细胞的经典标志物。小鼠体内表达 IGF1 的细胞会同步发出绿色荧光。结合流式、荧光显微镜、免疫荧光,定量分析 IGF1 表达水平,,就可以直观观察修复型细胞的定位、数量、形态及动态变化;最终达到体内外 / 原位示踪 IGF1 阳性细胞(即为中风小鼠模型的修复型小胶质细胞 / 髓系细胞)。

缺血损伤后第 6 天,研究者在患侧缺血半脑的CD45^int CD11b^int 细胞群中检测到 eGFP 阳性细胞,而对侧正常半脑内未发现该类细胞(图 1a)。脑卒中发病第 6 天,梗死周边区域绝大多数 eGFP 阳性细胞均表达 IBA1。于发病第 11 天清除Igf1阳性细胞后,小鼠脑卒中后的恢复进程受到明显阻碍,证实Igf1阳性髓系细胞在缺血性脑卒中修复阶段发挥重要作用。

对损伤后第 6 天脑组织中的Igf1阳性 CD45^int CD11b^int 细胞开展转录组测序(RNA-seq),最终筛选出391 个修复阶段相关基因,其中包含Spp1、Nenf、Gdf15等已被证实参与神经修复的神经营养因子编码基因(图 1b)。功能富集分析显示,这 391 个修复相关基因主要富集于血管生成、神经元突起发育及神经系统发育相关通路(图 1c)。

CD45^int CD11b^int 细胞是Igf1的主要表达细胞;该类细胞数量在脑卒中发病第 14 天达到峰值,随后逐渐减少(图 1d)。与之对应,上述 391 个修复相关基因的表达水平在发病第 28 天回落至接近基线水平(图 1e),说明 CD45^int CD11b^int 细胞在发病第 28 天左右丧失修复功能。

为标记这类功能耗竭的细胞,本研究利用CreER 系统,对脑卒中发病第 6 天已表达Igf1的修复型细胞进行谱系示踪(图 1f)。结果发现,原本表达Igf1、后续丧失该基因表达的细胞,仍留存于损伤后第 28 天的梗死周边区域(图 1g),且这类功能耗竭细胞的数量自发病第 14 天起持续增多(图 1h)。

通过单细胞转录组测序(scRNA-seq)对发病第 14 天的 CD45^int CD11b^int 细胞分群,共得到 5 个细胞亚群(CD45^int CD11b^int  1–5 群),各亚群均表达修复阶段特征基因(图 1i)。Igf1-CreER介导的 tdTomato 红色荧光信号在所有亚群中均有分布(图 1j)。对 tdTomato 阳性细胞进行转录轨迹分析证实,具备修复特征的细胞最终转变为功能耗竭细胞(图 1k)。

尽管从整体基因表达谱来看,这类功能耗竭细胞与假手术组小鼠的 CD45^int CD11b^int 细胞无明显差异(图 1i–k),但二者在常染色质区域存在特征区别(图 1l)。综上可知,修复型 CD45^int CD11b^int 细胞在停止表达修复相关基因后并未消失,而是长期滞留于脑卒中损伤区域,提示存在特定分子机制介导该类细胞修复功能的衰退。

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图1.丧失修复相关基因表达的CD45^int CD11b^int细胞仍留存于脑卒中损伤后的脑组织内。

为筛选可抑制修复阶段相关基因表达的关键转录调控因子,本研究利用转座酶可及染色质测序(ATAC-seq),分析 CD45^int CD11b^int细胞染色质表观修饰状态的时序变化。结果发现,脑卒中发病后第 14 天至 28 天,细胞中出现了特征性常染色质区域(图 2a)。

对上述常染色质区域开展转录因子基序富集分析,筛选出该时间段内在 CD45^int CD11b^int细胞中发挥作用的候选转录因子(图 2b)。研究同时发现,脑卒中后第 6 天的 CD45^int CD11b^int细胞,与持续表达Igf1的小胶质细胞系相比,二者Igf1基因位点周边的开放染色质区域特征相近。

随后,研究者在该小胶质细胞系中通过慢病毒载体过表达各候选转录因子,最终鉴定出Zfp384是终止细胞修复功能的关键因子,该蛋白可显著下调Igf1的表达(图 2c)。Zfp384与Igf1的表达水平呈负相关,且 ZFP384 的 DNA 结合能力是其抑制Igf1表达的必要条件。

脑卒中发病后第 6 天,CD45^int CD11b^int细胞内Zfp384表达略有下降,此后持续升高并直至第 28 天(图 2d),这一变化趋势与修复相关基因的时序表达特征恰好相反(图 1e)。单细胞转录组测序结果也证实,不表达修复相关基因的细胞亚群中Zfp384表达水平更高(图 2e);且在发病第 14 天的各 CCD45^int CD11b^int细胞亚群内,Zfp384表达量与修复相关基因表达量呈负相关(图 2f)。

缺血性脑卒中发生后,CD45^int CD11b^int髓系细胞包含脑内固有小胶质细胞与外周浸润的造血源性巨噬细胞,两类细胞均表达Cx3cr1;同时缺血损伤后,CD45^int CD11b^int细胞中小胶质细胞特异性标志物Hexb、Sall1的表达显著降低。基于此,本研究构建Cx3cr1-CreER 介导的 Zfp384 条件性敲除小鼠,用以探究 ZFP384 在小胶质细胞和巨噬细胞中的功能。

在脑卒中发病第 7 天给予4 - 羟基他莫昔芬(4-OHT) 诱导处理,至发病第 28 天时,在 IBA1 阳性细胞中已检测不到 ZFP384 蛋白表达(图 2g)。对 CD45^int CD11b^int细胞进行单细胞转录组测序分析显示,Cx3cr1-CreER; Zfp384^flox/flox(Zfp384 条件性敲除) 小鼠体内,修复阶段相关基因的表达出现明显上调。

与Zfp384^flox/flox对照组小鼠相比,Zfp384条件性敲除(cKO)小鼠体内修复相关基因的表达水平显著升高(图 2h)。对这些上调基因进行功能富集分析发现,其主要参与神经元突起形成、血管及神经系统发育等生物学过程(图 2i)。

脑卒中发病后第 14 天,两组小鼠的 CD45^int CD11b^int细胞均高表达修复阶段相关基因;但该表达特征仅在Zfp384条件性敲除小鼠中得以长期维持,对照组小鼠则逐渐消失(图 2j)。与之相符,相较于Zfp384^flox/flox小鼠,Zfp384条件性敲除小鼠的远期神经功能缺损得到明显改善(图 2k)。

两组小鼠的梗死体积、生理指标、脑血流量及生存率均无显著差异。上述结果表明,靶向 ZFP384 具备成为脑卒中康复治疗靶点的潜力。

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图2.ZFP384 可抑制 CD45^int CD11b^int细胞中修复阶段相关基因的表达。

研究团队随后设计了多种锁核酸(LNA)修饰、靶向Zfp384信使 RNA 的反义寡核苷酸,筛选发现ASO-2(下文统称 ASO-Zfp384)可显著下调Zfp384的表达。

将该反义寡核苷酸偶联 Cy3 荧光染料,并在脑缺血损伤后经脑室内给药,结果显示其可被 CD45^int CD11b^int 细胞大量摄取(图 3a)。与对照反义寡核苷酸相比,ASO-Zfp384 能明显抑制缺血性脑卒中后 CD45^int CD11b^int细胞内Zfp384信使 RNA 的表达(图 3b)。

在脑卒中发病第 8 天给予 ASO-Zfp384 干预,可显著改善小鼠远期神经功能缺损(图 3c)。给药组与对照组小鼠的脑梗死体积、脑血流量及生存率均无明显差异。该药物在老年小鼠模型中也展现出相近的治疗效果。

ASO-Zfp384 可上调修复阶段相关基因的表达(图 3d),并使发病第 28 天表达修复相关基因的 CD45^int CD11b^int细胞占比显著提升(图 3e)。该药物对 CD45^hi CD11b^hi细胞群无明显作用;且在Zfp384条件性敲除小鼠中,ASO-Zfp384 无法进一步改善远期神经功能缺损(图 3f)。以上结果证实,ASO-Zfp384 主要通过作用于 CD45^int CD11b^int细胞发挥治疗效果。

此外,即便在脑卒中发病第 29 天(慢性期)给药,ASO-Zfp384 仍能有效改善神经功能缺损(图 3g)。发病第 29 天给予药物干预后,Grn、Lgals9等修复相关基因的表达得以维持(图 3h),至发病第 56 天时,具备修复功能的 CD45^int CD11b^int细胞比例也明显上升(图 3i)。

综上,靶向Zfp384的反义寡核苷酸可延长 CD45^int CD11b^int细胞的修复作用,即便在缺血性脑卒中慢性阶段用药,也能持续促进神经功能恢复。

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图3.靶向Zfp384的反义寡核苷酸可延长 CD45^int CD11b^int细胞的修复功能,进而持续促进脑卒中恢复。

为了评估临床相关性,研究团队分析了人类缺血性中风后的脑组织样本。探究缺血性脑卒中后 ZFP384(人源蛋白命名为 ZNF384)与 IGF1 的表达关联。结果显示,脑卒中发病第 6 天,梗死周边区域内IGF1 阳性、IBA1 阳性的髓系细胞均不表达 ZNF384(图 6a)。对照组正常脑组织的 IBA1 阳性细胞中未检测到 ZNF384 表达;而脑卒中发病第 49 天的梗死周边区域,可观察到IGF1 阴性、ZNF384 阳性的细胞(图 6a)。

发病后 3 周内,梗死周边区域仍可检出 IGF1 阳性、IBA1 阳性细胞,3 周后该类细胞则极为少见(图 6b)。与之相反,ZNF384 阳性、IBA1 阳性细胞的数量自发病第 2 周起开始增多,且在发病第 5 至 7 周的梗死周边区域持续存在(图 6c)。

缺血性脑卒中发生后,ZNF384 阳性细胞数量与 IGF1 阳性细胞数量随时间变化呈负相关(图 6d)。上述结果表明,靶向抑制 ZFP384、以此维持脑部功能恢复的治疗策略,具备临床应用价值。

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图6.人脑卒中后脑组织中,ZFP384 的表达与 IGF1 表达呈负相关

总之,该研究揭示了中风后修复窗口关闭的一个关键机制。早期具有修复功能的小胶质细胞并未完全消失而是失能。ZFP384调控小胶质细胞丧失修复功能的关键机制,ZFP384通过干扰YY1介导的染色质互作,关闭修复性转录程序;证实靶向抑制ZFP384可重新激活小胶质细胞修复作用,促进髓鞘再生与突触重塑,即使在脑梗慢性期仍能有效改善神经功能。同时在人类脑组织中验证了临床相关性,为缺血性脑中风,尤其是康复期的新型靶向治疗提供了重要分子靶点和干预新思路。尽管目前证据主要来自小鼠模型和人类组织相关性分析,距离临床应用相距较远但是可期。

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原始文献

Tsuyama, J., Sakai, S., Kurabayashi, K. et al. Sustaining microglial reparative function enhances stroke recovery. Nature (2026). https://doi.org/10.1038/s41586-026-10480-0